SCRIPTORIUMPesquisa e publicação científicaResearch and scientific publishing

SCRIPTORIUM

Da pergunta de pesquisa ao artigo publicado.From research question to published paper.

Dr. Samuel Damin· NeuroLab 3D· EPM/Unifesp · Uninove· @sdramin

Escolha seu nívelChoose your level

Dá para trocar a qualquer momento no alto da página. Textos, exemplos, checklist e questões se ajustam ao nível.You can switch at any time at the top of the page. Texts, examples, checklist and questions adapt to the level.

Um roteiro para estudantes, residentes e pós-graduandos: método científico, bioestatística com calculadoras, busca de literatura com as ferramentas atuais (gratuitas e pagas), redação, escolha da revista e submissão. Há um caderno inteiro sobre neurocirurgia e neurociências, com revistas brasileiras e internacionais.

A roadmap for medical students, residents and graduate students: scientific method, biostatistics with working calculators, literature search with today's tools (free and paid), writing, choosing a journal and submitting. One whole notebook covers neurosurgery and neuroscience, with Brazilian and international journals.

Seus primeiros passosYour first steps

  1. 1Entender o métodoUnderstand the method

    O que é pesquisar e como não se enganar.

    What research is and how not to fool yourself.

    Caderno 0 →Notebook 0 →
  2. 2Ler artigosRead papers

    Em camadas: resumo, figuras, métodos.

    In layers: abstract, figures, methods.

    Caderno 0 →Notebook 0 →
  3. 3Buscar no PubMedSearch PubMed

    Palavras certas, AND e OR, acesso gratuito.

    The right words, AND and OR, free access.

    Caderno IV →Notebook IV →
  4. 4Entrar num grupoJoin a group

    Liga acadêmica, iniciação científica, orientador.

    Student group, undergraduate research, supervisor.

    Caderno 0 →Notebook 0 →
  5. 5Criar seus perfisSet up your profiles

    Lattes e ORCID desde o primeiro ano.

    Lattes and ORCID from year one.

    Caderno 0 →Notebook 0 →
  6. 6Ajudar num projetoHelp on a project

    Coleta de dados com planilha organizada.

    Data collection with a tidy spreadsheet.

    Caderno I →Notebook I →
  7. 7Resumo e pôsterAbstract and poster

    Seu primeiro texto científico, em 250 palavras.

    Your first scientific text, in 250 words.

    Caderno V →Notebook V →
  8. 8Relato de casoCase report

    Com orientação, consentimento e o checklist CARE.

    With supervision, consent and the CARE checklist.

    Caderno V →Notebook V →

Do TCC ao primeiro artigoFrom thesis to first paper

  1. 1Orientador e temaSupervisor and topic

    Um tema que caiba no seu tempo.

    A topic that fits your time.

    Caderno 0 →Notebook 0 →
  2. 2Pergunta PICOPICO question

    Um desfecho principal bem definido.

    One well-defined primary outcome.

    Caderno I →Notebook I →
  3. 3Busca e leituraSearch and reading

    PubMed, LILACS e um gerenciador de referências.

    PubMed, LILACS and a reference manager.

    Caderno IV →Notebook IV →
  4. 4Projeto e CEPProtocol and ethics

    Plataforma Brasil antes de coletar.

    Ethics approval before collecting.

    Caderno II →Notebook II →
  5. 5ColetaData collection

    Planilha com dicionário de dados.

    Spreadsheet with a data dictionary.

    Caderno I →Notebook I →
  6. 6AnáliseAnalysis

    O teste certo, efeito e IC 95%.

    The right test, effect and 95% CI.

    Caderno III →Notebook III →
  7. 7RedaçãoWriting

    IMRaD e o checklist do seu desenho.

    IMRaD and your design's checklist.

    Caderno V →Notebook V →
  8. 8Escolher a revistaChoose a journal

    Brasileiras sem taxa são bons primeiros alvos.

    Fee-free national journals are good first targets.

    Caderno VI →Notebook VI →
  9. 9SubmeterSubmit

    Carta ao editor e declarações.

    Cover letter and statements.

    Caderno VI →Notebook VI →
  10. 10Responder e apresentarRespond and present

    Revisores, defesa do TCC, congresso.

    Reviewers, thesis defence, conference.

    Caderno V →Notebook V →

Liderar uma linha de pesquisaLeading a research line

  1. 1Agenda de pesquisaResearch agenda

    Um problema central e uma sequência de estudos.

    One central problem and a sequence of studies.

    Caderno VI →Notebook VI →
  2. 2FinanciamentoFunding

    CNPq, CAPES, FAPESP e outras fontes.

    CNPq, CAPES, FAPESP and other sources.

    Caderno VIII →Notebook VIII →
  3. 3Equipe e orientaçãoTeam and supervision

    Papéis, autoria e prazos por escrito.

    Roles, authorship and deadlines in writing.

    Caderno VIII →Notebook VIII →
  4. 4Rede multicêntricaMulticentre network

    Registros, CDEs e acordos de dados.

    Registries, CDEs and data agreements.

    Caderno VII →Notebook VII →
  5. 5Gestão de dadosData management

    Plano de dados, BPC e integridade.

    Data plan, GCP and integrity.

    Caderno II →Notebook II →
  6. 6Métodos avançadosAdvanced methods

    Bayes, modelos mistos, predição.

    Bayes, mixed models, prediction.

    Caderno III →Notebook III →
  7. 7Inferência causalCausal inference

    Ensaio-alvo, estimandos, E-value.

    Target trials, estimands, E-value.

    Caderno I →Notebook I →
  8. 8Escrita de alto impactoHigh-impact writing

    Objetivos específicos e uma mensagem por artigo.

    Specific aims and one message per paper.

    Caderno V →Notebook V →
  9. 9Revisar e editarReview and edit

    Pareceres úteis e corpo editorial.

    Useful reviews and editorial boards.

    Caderno VIII →Notebook VIII →
  10. 10Inovação e patentesInnovation and patents

    NIT antes de divulgar.

    Tech-transfer office before disclosure.

    Caderno VIII →Notebook VIII →

A trilha de um artigoThe path of a paper

  1. 1PerguntaQuestion

    FINER e PICO; uma lacuna real, viável no seu serviço.

    FINER and PICO; a real gap, feasible where you work.

    Caderno I →Notebook I →
  2. 2LiteraturaLiterature

    Busca estruturada em PubMed, Embase, LILACS; o que já se sabe.

    Structured search in PubMed, Embase, LILACS; what is already known.

    Caderno IV →Notebook IV →
  3. 3ProtocoloProtocol

    Desenho, desfechos, tamanho amostral e plano de análise escritos antes.

    Design, outcomes, sample size and analysis plan written up front.

    Caderno I →Notebook I →
  4. 4Ética e registroEthics and registration

    Plataforma Brasil, TCLE ou dispensa, ReBEC, PROSPERO.

    Ethics committee, consent or waiver, trial and review registries.

    Caderno II →Notebook II →
  5. 5ColetaData collection

    Dicionário de dados, REDCap ou planilha travada, piloto.

    Data dictionary, REDCap or a locked spreadsheet, pilot.

    Caderno I →Notebook I →
  6. 6AnáliseAnalysis

    O teste certo, efeito com IC 95%, análise reprodutível em script.

    The right test, effect with 95% CI, reproducible scripted analysis.

    Caderno III →Notebook III →
  7. 7RedaçãoWriting

    IMRaD, diretriz EQUATOR do seu desenho, figuras e tabelas.

    IMRaD, the EQUATOR guideline for your design, figures and tables.

    Caderno V →Notebook V →
  8. 8RevistaJournal

    Escada de 3–4 revistas: escopo, impacto, prazo, custo.

    A ladder of 3–4 journals: scope, impact, speed, cost.

    Caderno VI →Notebook VI →
  9. 9SubmissãoSubmission

    Carta ao editor, declarações, formulários, revisores sugeridos.

    Cover letter, statements, forms, suggested reviewers.

    Caderno VI →Notebook VI →
  10. 10Revisão por paresPeer review

    Resposta ponto a ponto, cordial e verificável.

    Point-by-point response, courteous and verifiable.

    Caderno V →Notebook V →
  11. 11PublicaçãoPublication

    Provas, ORCID, Lattes, repositório e divulgação.

    Proofs, ORCID, institutional repository and dissemination.

    Caderno IX →Notebook IX →

Os cadernosThe notebooks

0Primeiros passosFirst stepsO que é pesquisar, ligas e iniciação científica, Lattes e ORCID, como ler um artigo.What research is, student groups and research projects, Lattes and ORCID, how to read a paper. IFundamentosFoundationsPergunta, desenhos de estudo (com seletor), vieses, causalidade, protocolo.Question, study designs (with a picker), bias, causality, protocol. IIÉtica e integridadeEthics and integrityLei 14.874/2024 e Inaep, CEP, TCLE, LGPD, registro, autoria, uso de IA.Brazil's new research-ethics law, consent, data protection, registration, authorship, AI. IIIBioestatísticaBiostatisticsSeis calculadoras: tamanho amostral, 2×2, teste diagnóstico, kappa, IC, escolha do teste.Six tools: sample size, 2×2, diagnostic test, kappa, CI simulator, test chooser. IVBusca e ferramentasSearch and toolsBases, MeSH/DeCS, construtor de busca PubMed, IA para literatura, revisão sistemática, acesso legal e Sci-Hub.Databases, MeSH, PubMed query builder, AI literature tools, systematic reviews, legal access and Sci-Hub. VEscrita científicaScientific writingIMRaD, diretrizes EQUATOR 2025–26, inglês sem falsos cognatos, carta ao editor, resposta aos revisores.IMRaD, EQUATOR 2025–26, English for Portuguese speakers, cover letter, reviewer response. VIRevistas e submissãoJournals and submissionMétricas, APC e acordos CAPES, explorador de 118 revistas, predatórias.Metrics, APCs and CAPES agreements, explorer of 118 journals, predatory journals. VIINeurocirurgia e neurociênciasNeurosurgery and neuroscienceEnsaios marcantes, IDEAL, escalas de desfecho, onde publicar por subárea, outras especialidades.Landmark trials, IDEAL, outcome scales, where to publish by subspecialty, other specialties. VIIICarreiraCareerFinanciamento, orientação, revisão por pares, patentes e visibilidade.Funding, supervision, peer review, patents and visibility. IXRoteiroRoadmapChecklist para cada nível, da ideia à divulgação, que guarda seu progresso.A checklist for each level, from idea to dissemination, that saves your progress. XQuestõesPractice questionsQuestões no formato ENAMED para cada nível, comentadas.Vignette-based questions for each level, with explanations. A–ZGlossárioGlossaryOs termos da pesquisa em linguagem simples, com busca.Research terms in plain language, with search.
Como usarHow to use

Leia em ordem na primeira vez; depois, use os cadernos como consulta. As glosas na margem trazem atalhos e armadilhas. Números de revistas (fator de impacto, taxas, prazos) mudam todo ano: o explorador mostra a fonte de cada um, e vale conferir no site da revista antes de submeter.

Read in order the first time, then use the notebooks for reference. The glosses in the margin hold shortcuts and pitfalls. Journal figures (impact factor, fees, turnaround) change every year: the explorer shows where each one came from, and you should confirm on the journal's site before submitting.